Przy śpiewie pieśni „Laudate Dominum” uczestnicy modlitwy z zapalonymi świecami w rękach, zgromadzili się przed ikoną Krzyża. W pierwszych rzędach zasiedli przedstawiciele innych wyznań, którym towarzyszył kard. Kurt Koch, prefekt Dykasterii ds. Popierania Jedności Chrześcijan. To on wprowadził w modlitwę, przypominając, że dziś przypada rocznica rozpoczęcia obrad Soboru Watykańskiego II w 1962 roku i podziękował za jego „ekumeniczne owoce”. Wspomniał również o 60. rocznicy soborowej konstytucji dogmatycznej o Kościele „Lumen gentium” i dekretu o ekumenizmie „Unitatis redintegratio”.

Po śpiewając „Adsumus” papież odmówił modlitwę o dar Ducha Świętego. Przedstawiciele Kościołów w swoich ojczystych językach odczytali słowa uwielbienia Boga, przeplatane śpiewem „Tibi Deo gloria”. Po czytaniu z księgi proroka Izajasza, śpiewie „Alleluja” i fragmencie Modlitwy Arcykapłańskiej Jezusa z Ewangelii wg św. Jana, powtórzonym w kilku językach z różnych kontynentów oraz pieśni „Bless the Lord, my soul”, zgromadzeni - zgodnie ze zwyczajem modlitw we Wspólnocie z Taizé - przez kilka minut modlili się w ciszy.

Następnie zabrzmiało „Kyrie eleison”, przelatane fragmentami wspomnianych dokumentów soborowych i intencjami modlitewnymi do Ducha Świętego: o jedność chrześcijan, wspólnotę świadectwa, „aby świat uwierzył”, solidarność wobec potrzebujących, pełną komunię eucharystyczną.

Po pieśni „Bogorodice diewo” odmówiono modlitwę „Ojcze nasz”. Papież odczytał końcową modlitwę i udzielił po angielsku błogosławieństwa. Na zakończenie odśpiewano pieśń „Beati voi poveri”.

Ekumeniczne czuwanie modlitewne w Watykanie przygotowali wspólnie: Sekretariat Generalny Synodu Biskupów, Dykasterię ds. Popierania Jedności Chrześcijan oraz Wspólnota z Taizé.